特區政府已成立跨部門的「非典型肺炎統籌小組」，協調各項預防及應付非典型肺炎病毒的工作。
統籌小組於三月二十九日由行政長官批示設立，社會文化司司長崔世安擔任主席，成員包括衛生局、教育暨青年局、社會工作局、消防局（緊急救援中心）、民政總署、新聞局及旅遊局等部門，因應事態發展，執行相關應變措施。
統籌小組今（三）日舉行首次會議，各部門代表分別匯報了經已開展的各項工作和進度。
小組會繼續與世界衛生組織、國家衛生部及鄰近地區保持密切聯繫，掌握病毒的最新資訊，一旦證實在本澳出現病例，將設立24小時運作的指揮中心，並即時通報世界衛生組織及國家衛生部，邀請專家小組來澳支援，同時根據世衛組織指引，對病人進行隔離治療。
本澳至今未發現非典型肺炎病例。各部門已制定及推行一系列預防病毒、清潔及消毒的指引，同時加強對醫院、學校、以至社區等層面的宣傳教育，令市民提高警覺，注重個人及環境衛生。
