新型冠狀病毒感染應變協調中心表示，第3次全民核檢站由52個減至41個是經過分析而定，主要是減少了設於酒店內規模較小的自費核檢站，加上有關核檢站的採樣點數目少，動員變化能力不大，且容易造成人員聚集；與此同時，考慮到今次急需通關的人士減少，預計有關自費站點需求減少。雖然今次核檢站數目有所減少，但全澳免費採樣點和採樣人員的總數變化不大，分析及總結首2次全民核檢的經驗，因此做出調整。

應變協調中心又指出，數據顯示，第2次全民核檢首3小時總共採樣為42,537人，第3次全民核檢首3小時總共採樣為56,151人，同比增加13,614人；而根據網上實時數據，各個核檢站的輪候情況理想。