水警稽查局總部於2001年8月13日起遷往新址並如常辦公，其轄下部份單位亦有如下更改：
水警稽查局總部、資源管理廳及行動管理廳將遷往媽閣上街嘉路一世船塢西南端，電話：559944。海上巡邏廳及海上巡邏處的地址為青洲上街，電話：9894404。而澳門警務警司處則位於媽閣上街嘉路一世船塢，電話：9894446。
