世界卫生组织流感大流行警示维持在6级，严重程度为中等；本澳警示级别为第6级蓝色，本地疫情为一般。

5月12日，因流感样症状而到仁伯爵综合医院急症室求诊的儿童占儿科求诊人数的41%，成人则占成人求诊人数的19%。5月12日，没有新增确诊感染甲型H1N1流感患者。由去年6月18日至今，累计已有3609人确诊感染新型H1N1流感，17名感染者患肺炎，4名感染者需要使用呼吸机治疗，2名感染者死亡。

5月13日，卫生局没有接获学校或院舍出现流感样疾病群集性感染的报告。 5月12日出现群集性感染的培正中学K1A班新增1名学生出现发热、咳嗽等上呼吸道病征。化验结果证实上述流感样疾病群集性感染不是由新甲型H1N1流感病毒引起，有关样本正作进一步检验。卫生局仍在继续密切监测学校、院舍和其他机构流感流行情况。

截至5月13日下午，没有甲型H1N1确诊患者需要住院接受治疗。

5月13日，有14人次接受了H1N1流感疫苗接种，累计已有116067人次接受了H1N1流感疫苗接种。

另外，5月12日出现肠病毒群集性感染的妇联第三托儿所小班，新增2名患儿出现手足口病病征。化验结果证实上述肠病毒群集性感染不是由EV71型肠病毒引起，有关样本正作进一步检验。