經粵澳兩地政府提請，國務院於2020年3月2日作出批覆，同意橫琴口岸澳方口岸區及相關延伸區旅檢區域自2020年3月18日零時起啟用並適用澳門特別行政區法律實施管轄。澳門特別行政區立法會亦已於2020年3月16日細則性通過《訂定在橫琴口岸澳方口岸區及相關延伸區適用澳門特別行政區法律的基本規範》法案，該法律於2020年3月18日零時生效，訂定橫琴口岸澳方口岸區及相關延伸區自啟用之日起適用澳門特別行政區法律。

為此，澳珠兩地政府於2020年3月18日零時在橫琴新口岸旅檢大廳一樓舉行橫琴口岸澳方口岸區移交儀式。儀式上，珠海市台港澳工作辦公室主任鄒樺宣讀了國務院有關批覆，隨後橫琴新區管委會副主任吳創偉將橫琴口岸澳方口岸區象徵物（橫琴口岸澳方口岸區模型）交予澳門保安部隊事務局局長郭鳳美。

横琴新口岸分三個階段移交澳方，第一階段包括旅檢大樓、出入境疏散平台及蓮花大橋原內地管轄的主橋等，總面積為66,428平方米；第二階段包括永久客貨車通道、隨車人員驗放廳，以及澳門大學通往横琴新口岸通道橋(珠方預計2021年底建成)等；第三階段包括澳門輕軌延伸至橫琴口岸預留的區域。

是次移交澳方啟用的口岸區屬第一階段的區域，其標誌着粵澳基礎設施互聯互通又邁進一大步。隨着未來口岸的開通，將更加方便澳門居民在橫琴工作、生活和投資，促進區內人員、物資高效便捷流動，有利推動“横琴粵澳深度合作區”的建設。

出席儀式的澳方代表分別來自保安司司長辦公室、澳門海關、保安部隊事務局、治安警察局、消防局、市政署、土地工務運輸局、衛生局及交通事務局等部門，珠方代表分別來自珠海市台港澳工作辦公室、橫琴新區管委會、橫琴新區商務局、武警執勤二支隊、橫琴海關及橫琴邊檢等部門。

移交儀式完結後，澳門海關、治安警察局、消防局及司法警察局陸續派員進駐，依法執行治安管理任務，同時將有序進行口岸邊檢大樓及行車通道等各項設施設備的完善和測試工作。隨後保安當局將與珠海相關部門聯合進行通關設備聯調聯試、通關壓力測試、電力全負荷測試，以及進行各類演習，確保將來實施“合作查驗、一次放行”通關模式的横琴新口岸正式開通後安全、順暢、高效運行。

在橫琴新口岸未通關前，市民及旅客進出橫琴仍需使用現在的蓮花口岸。

澳門蓮花口岸遷至橫琴口岸計劃於2018年10月獲國務院批准後，特區政府就此成立蓮花口岸遷關聯合工作小組，聯合工作小組由保安司司長黃少澤負責統籌，下設通關、法律、建設及綜合四個工作小組。工作小組在珠海市政府的大力支持及協助下，開展相關工作，並與珠海有關機構保持緊密聯繫，對接各項工作，確保横琴口岸澳方口岸區順利開通。

目前，澳門特區與珠海兩地政府保持緊密溝通與協調，共同推動橫琴新口岸整體建設進度，爭取於2021年底完成第二階段的各項相關工作，並為第三階段的建設作好準備。