為分流非緊急的急診病人，強化與非牟利醫療機構的合作，衛生局一直有資助非牟利醫療機構向10歲或以下的兒童、65歲或以上之人士和持有效由教育暨青年局發出屬正規教育學生證的中、小學生提供免費的一般門診服務，此外，由2015年1月1日開始亦擴大非牟利醫療機構的免費門診服務對象至持有社會工作局發出有效殘疾評估登記證的澳門永久性居民，與此同時，衛生局正研究將非牟利醫療機構的免費門診服務對象擴展至公務員和其家屬，以及教師和在教育機構任職的其他工作人員。

提供免費門診服務的非牟利機構包括：澳門工會聯合總會轄下的各工人醫療所、澳門歸僑總會診所、澳門民眾建澳聯盟轄下民眾醫療中心，及澳門中華新青年協會轄下的信和醫療中心。