新型冠状病毒感染应变协调中心表示，第3次全民核检站由52个减至41个是经过分析而定，主要是减少了设于酒店内规模较小的自费核检站，加上有关核检站的采样点数目少，动员变化能力不大，且容易造成人员聚集；与此同时，考虑到今次急需通关的人士减少，预计有关自费站点需求减少。虽然今次核检站数目有所减少，但全澳免费采样点和采样人员的总数变化不大，分析及总结首2次全民核检的经验，因此做出调整。

应变协调中心又指出，数据显示，第2次全民核检首3小时总共采样为42,537人，第3次全民核检首3小时总共采样为56,151人，同比增加13,614人；而根据网上实时数据，各个核检站的轮候情况理想。