卫生局表示，辖下的药物事务厅负责执行药事法规，依法监督管理所有与西药、中药及传统药物有关的活动，包括药物的生产、进口、分销、供应及广告宣传等，从而确保市民获得安全、有效以及具有质量保证的药物。

在药房监管方面，截至2011年12月31日止，本澳获发准照药房有145间，中药房128间，卫生局分别根据第58/90/M号法令(管制在澳门从事药物专业及药物业活动)及第53/94/M号法令(管制中药配制及贸易之场所订定发出准照制度及运作条件)对本澳的药房及中药房作出监督管理。

为确保药房依法经营，卫生局对所有药房进行定期及突击巡查，对药房的管理、药物保存、调配、病患的用药指导及药品广告等作出整体的技术性评估，确保药事法规得以严格遵守及贯彻执行。此外，在定期巡查中已增设非办公时间（如晚间及周末）的稽查，强化打击违规活动，并起警惕阻吓作用。此外，在接获投诉后或在有合理理由怀疑药房有违规行为时亦会派员调查，并依法开立实况笔录。倘调查属实，卫生局依法对违规者作出惩处。在2010年，卫生局共对9间违规药房作出处罚，而2011年则对7间药房作出处罚，违规情况主要为药房在没有技术人员驻店下运作、错误调配药物、调配过期药物等。另外，2010年卫生局接获涉及药房的检举／投诉个案有12宗，2011年则有18宗，主要因药品质量问题、不良经营手法及错误调配药物等。另一方面，因应香港某药厂生产工艺问题以及塑化剂事件等，卫生局于2010年回收了279批药物，2011年回收了51批。该两年间，卫生局向卫生专业人士分别发出了38及37则药物安全资讯。

随着近年社会迅速发展，市民提高了对药剂服务的要求，现行药物业活动法令法规于早期(最早于1990年)颁布，当中存在未能满足行业和社会发展需要的情况。因此，卫生局现正分阶段对现行药事法规作检讨和修订，进一步加强对业界监管的力度。另一方面，卫生局亦持续优化部门内部质量管理工作，增加行政效率及透明度，强化廉政建设，逐步完善药物监管工作的质量保证系统，持续提升服务质素，增加市民满意度。