就有市民反映社会上有些已享有医疗津贴的人士，对医疗券需求不大，导致有人选择将剩余的医疗券用来购买参茸海味，故建议转发「食物券」。卫生局强调，医疗券的主要目的之一是，除补贴市民医疗开支，亦鼓励加强个人保健。故此，医疗券不只限于诊治小病，亦可进行身体检查、牙齿护理、注射疫苗等。卫生局重申，医疗券不可用于购买参茸海味，任何人士发现违规情况，请致电2822 5050举报。

此外，《医疗补贴计划》同时体现扶助私人卫生单位经营和发展的目的，据统计暨普查局《2009年医疗统计》指出，因政府推出的《医疗补贴计划》，令前往私家诊所的求诊人次显着上升16.2%。

而卫生局也非常关注医生拒收医疗券或对使用医疗券人士提高诊费的行为，并采取了多项监管措施，包括展开500多次联合巡查、常规巡查及现场定点观察。目前，经证实存在违规行为而被解除协议的参与单位有10个，其中有8名为中药房驻诊中医。

至于有市民反映，医疗券结算制度需时过长，许多私人医生不愿参加，卫生局表示，早于去年改为每月进行两次结算和转账，一般可在结算期后30日内获支付有关款项，这一安排效果良好。目前，有651个私人卫生单位、合共1143位医生加入2010年度计划，占合资格参与医生的8成。

2011年度《医疗补贴计划》将于6月1日启动，卫生局已于5月11日及12日举行了两场业界讲解会，目前为止已有300多个单位提交加入新一年计划的申请。